Η σειρά Elfen Lied εκτυλίσσεται γύρω από μεταλλαγμένα ανθρώπινα όντα, ονομαζόμενα ως Δικλώνια (δι+ κλώνος, δηλαδή τα όντα αυτά ξεχωρίζουν από τα δυο κέρατα που είναι προέκταση του κρανίου τους, και τα οποία μοιάζουν με τα αυτιά μιας γάτας, ευρέως διαδεδομένος σχεδιασμός σε manga και anime). Επίσης χάρη στα κέρατα αυτά, τα Δικλώνια κατέχουν τηλεκινητικές δυνάμεις, ένα χαρακτηριστικό των οποίων είναι οι βεκτορες. Βεκτορες ονομάζονται τα αόρατα χέρια που κατέχουν τα Δικλώνια, τα οποία έχουνε μεγάλη ελαστικότητα και διάμετρο, και επίσης μπορούν να διαμελίσουν ανθρώπινα μέλη με εξαιρετική ευκολία. Οι επιστήμονες φυλάσσουν τα Δικλώνια μέσα σε κελιά, όπου τα εξετάζουν ως πειραματόζωα σε απάνθρωπες συνθήκες, είτε τα θανατώνουν όταν διαπιστώσουν πως αυτά έχουν αναπτύξει βίαιη και θανατηφόρα συμπεριφορά. Όλα αυτά βέβαια μέχρι που η κύρια πρωταγωνίστρια της σειράς, ονόματι Lucy, δραπετεύει με άκρως μακάβριο τρόπο από το μυστικό ιατρικό εργαστήριο, και από κει ξεκινάει η ιστορία....